Gagnvirkar lotur

Stundum er nauðsynlegt að keyra hugbúnað - eða samsetningu hugbúnaðar - beint frá skipanalínunni á hnút (t.d. fyrir gagnagreiningu og meðferð).

Til dæmis:

[..]$ srun --job-name "InteractiveJob" --partition 48cpu_192mem --cpus-per-task 24 --mem-per-cpu 3900 --time 1-00:00:00 --pty bash

SLURM tímaáætlarinn mun úthluta umbeðnu tilfangi (ef það er tiltækt), í þessu dæmi 24 örgjörvum frá reiknihnút í 48cpu_192mem skiptingunni og 3900MB af vinnsluminni á hvern kjarna. Keyrslan mun standa í 1 dag (0-00:00:00 : D:HH:MM:SS)

Til að sjá hvaða skiptingar eru í boði skaltu slá inn:

[..]$ sinfo

Lýsingu á skiptingunum er að finna í Skilrúm og búnaður.

Athugið

Það er mikilvægt að taka alltaf fram --mem-per-cpu, og það er mælt með að hafa það minnst 3900MB á hvern kjarna. Þú getur beðið um meira minni ef þess er þörf.

SLURM biðröðin og mörk eru í gildi hér.

Þegar gagnvirka lotan er hafin munt þú vera skráður inn á reiknihnútin:

[<uname>@compute-xx]$

Loka lotunni.

Eftir að þú hefur klárað verkefni þín í gagnvirku lotuni skalt þú vinsamlegast loka lotunni til að gera auðlindina aðgengilega öðrum notendum:

[<uname>@compute-xx]$ exit

Geymd Gagnvirk lota

Ef notandi missir tengingu, eða lokar skipana glugganum, mun gagnvirka lotan hætta og öll ógeymd vinna mun eyðast. Til að koma í veg fyrir þetta er hægt nota tmux til að geyma gagnvirku lotuna í aðskyldum skipanaglugga.

Fyrst virkjum við tmux:

[..]$ tmux                                          

og byrjum gagnvirka lotu:

[..]$ srun --job-name “InteractiveJob” --partition <partition-name> --cpus-per-task 32 --mem-per-cpu 3900 --time 1-00:00:00 --pty bash                                          

Gagnvirka lotan keyrir nú á tmux. Eftir að keyrslan er farin af stað getur þú lokað skipanaglugganum. Þú getur einnig losað þig frá tmux lotunni og farið til baka á innskráningarhnútin með því að ýta á ctrl+b og þar á eftir d. Verkið þitt mun halda áfram að keyra.

Til að virkja lotuna aftur eftir innskráningu á Elju:

[..]$ tmux attach

Þegar verki þínu er lokið (og þú hefur lokað gagnvirku lotuni þinni) munið þá að loka einnig tmux lotuinni svona:

[..]$ tmux kill-session

Margar Gagnvirkar Lotur

Þú getur byrjað nýjar eða margar tmux lotur og mælt er með því að gefa hverri lotu nafn. Hér byrjum við lotu sem heitir inter-1

[..]$ tmux new -s inter-1

fylgt eftir með gagnvirkri keyrslu. Eftir lokun eða losun geturðu tengst nefndri lotu aftur svona:

[..]$ tmux attach-session -t inter-1                                                               

Þegar þú ert búinn með verkið (og endað gagnvirku lotuna), geturðu endað nafngreinda lotu svona:

[..]$ tmux kill-session -t inter-1                           

Athugið

Þegar þú hefu Þegar gagnvirku keyrsluni er lokið (hvort sem þú notar tmux eða ekki) á tölvuhnút er mikilvægt að ljúka gagnvirku lotunni:

[<uname>@compute-xx]$ exit

Ef þú ert ekki viss um hvernig á að tengjast aftur við hnútinn geturðu alltaf fengið lista af þínum lotum svona:

[..]$ squeue -u $USER
JOBID PARTITION     NAME    USER    ST  TIME  NODES NODELIST(REASON)
11729 48cpu_192 Interact   <uname>  R   2:10      1 compute-17

og stöðvað lotuna með því að nota starfsauðkennið (í þessu dæmi 11729)

[..]$ scancel 11729